MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187118	CAGG	2	8	92	99	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NT_187118	ATA	2	6	133	138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187118	GCC	2	6	156	161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NT_187118	TTA	3	9	180	188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187118	ACC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NT_187118	ATT	2	6	3062	3067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187118	CAAT	2	8	3068	3075	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NT_187118	AT	3	6	3077	3082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187118	ATT	2	6	3112	3117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187118	GAA	2	6	3220	3225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187118	TAA	2	6	4558	4563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187118	GAG	2	6	4576	4581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187118	AAG	2	6	4625	4630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187118	TTA	2	6	5615	5620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187118	CGG	2	6	5649	5654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187118	CTCA	2	8	5688	5695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NT_187118	AG	3	6	5766	5771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187118	GGT	2	6	5785	5790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187118	CTA	2	6	5802	5807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NT_187118	ACA	2	6	5818	5823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NT_187118	AATT	2	8	5837	5844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187118	ATT	2	6	5926	5931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187118	AAT	2	6	5982	5987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187118	GTT	2	6	5988	5993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187118	TCC	2	6	6497	6502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NT_187118	GTC	2	6	6503	6508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NT_187118	CGG	2	6	6512	6517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NT_187118	CGC	2	6	6542	6547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NT_187118	A	6	6	6712	6717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187118	ATTA	2	8	6762	6769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187118	TGA	2	6	6799	6804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187118	CGA	2	6	6838	6843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187118	TCG	2	6	7492	7497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187118	CGA	2	6	7505	7510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187118	T	6	6	7533	7538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187118	AGCC	2	8	7820	7827	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NT_187118	GACA	2	8	7837	7844	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NT_187118	TAC	2	6	7856	7861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187118	CAT	2	6	7866	7871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NT_187118	GA	4	8	11124	11131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187118	CGC	2	6	11158	11163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NT_187118	AAT	2	6	11211	11216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187118	TAT	2	6	11250	11255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187118	TGG	2	6	12280	12285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187118	CA	3	6	12311	12316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NT_187118	TC	3	6	17735	17740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NT_187118	A	6	6	17751	17756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187118	GGC	2	6	17792	17797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_187118	CTA	2	6	17831	17836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187118	ACCA	2	8	22606	22613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NT_187118	GCA	2	6	22617	22622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187118	ATC	2	6	22639	22644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187118	A	6	6	22713	22718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187118	CAG	2	6	22720	22725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187118	TGC	2	6	22776	22781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NT_187118	GC	3	6	22823	22828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NT_187118	GC	3	6	24869	24874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NT_187118	TAC	2	6	24888	24893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NT_187118	ATCT	2	8	24902	24909	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NT_187118	A	7	7	25991	25997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187118	TTAA	2	8	26005	26012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187118	TATT	2	8	26014	26021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187118	AC	3	6	26033	26038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NT_187118	TGT	2	6	26064	26069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187118	CGA	2	6	27804	27809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NT_187118	TTCG	2	8	27851	27858	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NT_187118	T	6	6	27897	27902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187118	AGA	2	6	27916	27921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187118	CA	3	6	27926	27931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NT_187118	T	6	6	29957	29962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187118	CAT	2	6	29985	29990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NT_187118	TTC	2	6	30005	30010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NT_187118	CA	3	6	32642	32647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NT_187118	CAT	2	6	32677	32682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NT_187118	TCA	2	6	32688	32693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187118	AATG	2	8	32694	32701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187118	CTT	2	6	32712	32717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187118	GCT	2	6	32742	32747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187118	GTT	2	6	32820	32825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187118	GCA	2	6	32828	32833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187118	CATT	2	8	32983	32990	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NT_187118	A	7	7	33008	33014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187118	ATT	2	6	33019	33024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187118	GAA	2	6	33046	33051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187118	AG	3	6	33054	33059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187118	CCG	2	6	33091	33096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NT_187118	AATA	2	8	33099	33106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187118	ATTT	2	8	33132	33139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187118	ACA	2	6	33169	33174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187118	A	6	6	33210	33215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187118	CGC	2	6	33227	33232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NT_187118	T	6	6	34608	34613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187118	ATT	2	6	35793	35798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187118	AAG	2	6	35859	35864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187118	AT	3	6	37996	38001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187118	AAT	2	6	38015	38020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187118	A	6	6	38741	38746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187118	GA	3	6	38776	38781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187118	AAT	2	6	38816	38821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187118	AAAT	2	8	38828	38835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187118	TAA	2	6	38836	38841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187118	AT	4	8	38858	38865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187118	CAT	2	6	38885	38890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NT_187118	T	9	9	38934	38942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187118	TAA	2	6	38997	39002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187118	CTT	2	6	43422	43427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NT_187118	GAT	2	6	43497	43502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187118	T	6	6	43518	43523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187118	TGG	2	6	43527	43532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187118	TAA	2	6	43871	43876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187118	CT	3	6	43949	43954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NT_187118	TATT	2	8	43979	43986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187118	ATT	2	6	44091	44096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187118	ACAG	2	8	44097	44104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NT_187118	AAATA	2	10	44174	44183	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187118	TTA	2	6	44229	44234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187118	GTAA	2	8	44240	44247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187118	GGCG	2	8	44468	44475	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NT_187118	TGC	2	6	44501	44506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NT_187118	CGG	2	6	44527	44532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NT_187118	TCC	2	6	44538	44543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.